近年来，以创新型、创业型、成长型中小企业为主的新三板挂牌公司普遍注重研发，整体研发投入持续增长。全国股转系统8月24日发布的统计数据显示，截至2018年8月24日已公布半年报的6372家新三板挂牌企业总计研发费用总额达158.90亿元，同比增长28.62%，其中研发费用占营业收入的比重为4.74%，部分高新技术类挂牌公司研发投入持续加大，业绩增长明显。
统计数据显示，有研发费用的5021家挂牌公司今年上半年营业收入达3355.02亿元，同比增长18%。其中，研发费用超过500万元的新三板公司817家，超过1000万元的公司230家。信息技术、工业制造、新材料、文化创意等行业挂牌公司研发投入排名前列，部分企业研发投入超过亿元。
在目前已经公布半年报的新三板挂牌公司中，1073家挂牌公司研发费用占营收比重超过10%，135家公司超过50%，56家公司超过100%。从行业情况来看，研发投入金额较多的行业主要是信息技术、材料和医疗保健行业，2018年上半年的研发投入分别为62.97亿元、24.28亿元、8.93亿元，同比增长23.18%、38.77%和35.92%。从行业来看，三个行业的平均研发投入分别为375万元、340万元和291万元，高于新三板市场平均的284万元。
2015年—2017年，新三板挂牌公司中，有研发投入的企业数量不断增加，研发金额呈逐年上升态势。2017年10991家完整披露年报的挂牌公司中，有7140家公司连续三年均具有研发投入。这些挂牌公司2015年、2016年、2017年的研发总投入分别为421.30亿元、522.81亿元、580.69亿元。同期合计营业收入分别为8225.50亿元、1015.83亿元、12186.97亿元。研发投入占比分别为5.12%、5.14%、4.76%。
数据显示，7140家有研发投入的公司在盈利能力、资本结构、营运能力等方面均高于新三板挂牌公司平均水平。连续三年有研发投入的挂牌公司在净资产收益率上平均高出后者约1个百分点左右，且资产负债率较市场平均水平高出近2个百分点，存货周转率高出约0.8次。
2018年上半年，研发费用突破2000万元的挂牌公司有51家，研发投入排名前列的企业有圣泉集团、合全药业、华强方特，分别为1.50亿元、0.75亿元、0.70亿元。其中圣泉集团和华强方特在2017年的研发投入排名中位居前列。今年上半年，三家公司的营业收入为29.38亿元，12.1亿元和19.36亿元，同比增长31.13%，19.29%和7.09%；净利润为2.73亿元、2.65亿元和3.61亿元，同比增长15.95%、11.35%和11.60%。
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